1846 wurde der Pfarrerssohn Ludwig Doll in Kirchen an der Sieg geboren. Nach dem Theologiestudium in Erlangen, Bonn, Tübingen wurde er ab 1871 als Pfarrer der reformierten Gemeinde Neukirchen. 1878 gründete er die Waisen- und Missionsanstalt Neukirchen sowie 1882 die Neukirchener Mission – bewusst den Werten der Evangelischen Allianz verpflichtet. Das Missionsseminar war dabei von Anfang an nicht nur als Ausbildungsstätte für Auslandsmissionare, sondern auch für Evangelisten im Inland konzipiert.

Als die Freien evangelischen Gemeinden sich 1911 zur Gründung einer eigenen Predigerschule in Wuppertal entschlossen, wurde die Neukirchener Mission angefragt, ob sie denn nicht die „Ausbildung der Zöglinge“ übernehmen könne. Dieses Ansinnen lehnte sie 1923 ab, da sie sich nicht konfessionell binden wollte. Auch 1946 und 1952 führten Gespräche über die Zusammenarbeit zwischen NM und dem Bund FeG bzw. der Mission desselben zu keinem Konsens.

Nach mehrmonatiger Evangelisationstätigkeit des streitbaren Predigers Frederik Franson in Barmen kam es 1889 durch Heinrich Mandel – einen Inspektor der Neukirchener Mission – zur Begegnung von Franson mit Carl Polnick. Von dessen glühendem Aufruf zur Mission in China bewegt, gründete Polnick mit anderen den „Allianz-Mission-Verein“, ebenfalls ganz bewusst auf Basis der Werte der Evangelischen Allianz. Schon zu Gründungszeiten waren Mandel und Polnick im Gespräch. Warum die Allianz-Mission gegründet und nicht stattdessen Missionare der Neukirchener Mission entsandt wurden, lässt sich heute aufgrund spärlicher Quellen nicht mehr mit Bestimmtheit sagen.

Die Suche des Bundes freier evangelischer Gemeinden nach der Verbindung mit einer Missionsgesellschaft führte bei der Neukirchener Mission zu keinem Erfolg. Stattdessen ging Ende der fünfziger Jahre die Allianz-Mission eine enge Verbindung mit dem Bund FeG ein und die Verbindung zur Neukirchener Mission schwand.